Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NME1P15531 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME1P15531 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME1P15531 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME1P15531 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME1P15531 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME1P15531 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME1P15531 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME1P15531 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME1P15531 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME1P15531 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME1P15531 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NME1P15531 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME1P15531 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME1P15531 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME1P15531 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME1P15531 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME1P15531 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME1P15531 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME1P15531 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME1P15531 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME1P15531 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NME1P15531 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME1P15531 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME1P15531 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME1P15531 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME1P15531 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME1P15531 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME1P15531 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME1P15531 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME1P15531 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME1P15531 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME1P15531 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME1P15531 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms