Protein–RNA interactions for Protein: P15086

CPB1, Carboxypeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB1P15086 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPB1P15086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPB1P15086 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPB1P15086 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPB1P15086 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPB1P15086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPB1P15086 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPB1P15086 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPB1P15086 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPB1P15086 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPB1P15086 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPB1P15086 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPB1P15086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPB1P15086 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPB1P15086 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPB1P15086 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPB1P15086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPB1P15086 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPB1P15086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPB1P15086 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPB1P15086 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPB1P15086 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPB1P15086 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPB1P15086 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPB1P15086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPB1P15086 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPB1P15086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPB1P15086 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPB1P15086 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPB1P15086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPB1P15086 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPB1P15086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPB1P15086 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPB1P15086 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPB1P15086 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPB1P15086 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPB1P15086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPB1P15086 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPB1P15086 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPB1P15086 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPB1P15086 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPB1P15086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPB1P15086 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPB1P15086 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPB1P15086 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPB1P15086 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPB1P15086 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPB1P15086 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms