Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD2P13995 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD2P13995 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms