Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXD8P13378 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD8P13378 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms