Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC00271P0C7V0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00271P0C7V0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00271P0C7V0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262 ms