Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSLP07711 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSLP07711 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSLP07711 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSLP07711 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSLP07711 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSLP07711 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSLP07711 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSLP07711 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSLP07711 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSLP07711 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSLP07711 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSLP07711 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSLP07711 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSLP07711 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSLP07711 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSLP07711 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSLP07711 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSLP07711 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSLP07711 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSLP07711 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSLP07711 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSLP07711 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSLP07711 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSLP07711 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSLP07711 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSLP07711 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSLP07711 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSLP07711 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSLP07711 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSLP07711 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSLP07711 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSLP07711 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSLP07711 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSLP07711 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSLP07711 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSLP07711 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSLP07711 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSLP07711 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSLP07711 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSLP07711 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSLP07711 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSLP07711 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSLP07711 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSLP07711 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSLP07711 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms