Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNB1P01574 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms