Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1O95476 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTDNEP1O95476 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1O95476 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms