Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPINO95295 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAPINO95295 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNAPINO95295 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms