Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC22O60826 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC22O60826 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms