Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC48.88■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC48.86■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC48.85■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC48.83■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC48.82■■■■■ 5.41
ABCC9O60706 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC48.78■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
ABCC9O60706 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC48.7■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC48.69■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
ABCC9O60706 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.66■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC48.64■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC48.63■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
ABCC9O60706 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC48.62■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC48.62■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC48.61■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.61■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC48.61■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC48.6■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC48.6■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC48.58■■■■■ 5.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms