Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC11O43248 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC11O43248 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC11O43248 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms