Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP290O15078 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP290O15078 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP290O15078 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP290O15078 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP290O15078 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP290O15078 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP290O15078 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP290O15078 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP290O15078 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms