Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLGNO14967 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLGNO14967 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLGNO14967 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLGNO14967 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLGNO14967 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLGNO14967 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLGNO14967 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLGNO14967 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLGNO14967 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLGNO14967 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLGNO14967 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLGNO14967 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLGNO14967 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLGNO14967 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLGNO14967 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLGNO14967 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLGNO14967 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLGNO14967 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLGNO14967 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLGNO14967 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLGNO14967 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLGNO14967 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLGNO14967 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLGNO14967 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLGNO14967 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLGNO14967 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLGNO14967 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLGNO14967 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLGNO14967 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLGNO14967 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLGNO14967 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLGNO14967 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLGNO14967 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLGNO14967 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLGNO14967 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms