Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCRL2O00421 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCRL2O00421 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCRL2O00421 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCRL2O00421 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCRL2O00421 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCRL2O00421 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCRL2O00421 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCRL2O00421 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCRL2O00421 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCRL2O00421 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCRL2O00421 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCRL2O00421 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCRL2O00421 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCRL2O00421 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCRL2O00421 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCRL2O00421 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCRL2O00421 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCRL2O00421 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCRL2O00421 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCRL2O00421 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCRL2O00421 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCRL2O00421 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms