Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QLW9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QLW9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QLW9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3QLW9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3QLW9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3QLW9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QLW9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QLW9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QLW9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QLW9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QLW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QLW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QLW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QLW9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QLW9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QLW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QLW9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QLW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QLW9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QLW9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QLW9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QLW9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3QLW9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3QLW9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QLW9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QLW9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QLW9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QLW9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QLW9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QLW9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.3 ms