Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQV1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQV1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQV1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BQV1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BQV1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BQV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BQV1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BQV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BQV1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQV1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQV1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
H3BQV1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
H3BQV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
H3BQV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BQV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BQV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BQV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BQV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BQV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BQV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BQV1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BQV1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BQV1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BQV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQV1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQV1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQV1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BQV1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BQV1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BQV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BQV1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms