Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB9F8W1W9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB9F8W1W9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB9F8W1W9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB9F8W1W9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB9F8W1W9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB9F8W1W9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB9F8W1W9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms