Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPBD1B2RD01 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms