Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L9A6NEM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms