Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARFGEF2Q9Y6D5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms