Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB6Q9Y5E3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCDHB6Q9Y5E3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms