Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3HQ9Y535 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3HQ9Y535 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms