Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIGD1AQ9Y241 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1AQ9Y241 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIGD1AQ9Y241 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms