Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms