Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA2Q9UL42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PNMA2Q9UL42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms