Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM7Q9UK45 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM7Q9UK45 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms