Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGA2Q9UJY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms