Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA2Q9UJY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA2Q9UJY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGA2Q9UJY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms