Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MID2Q9UJV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MID2Q9UJV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MID2Q9UJV3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms