Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA1Q9UIW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA1Q9UIW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA1Q9UIW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms