Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH4Q9UIA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH4Q9UIA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms