Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC3Q9UHC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC3Q9UHC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC3Q9UHC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1890.1 ms