Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPG2Q9UBF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms