Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC88CQ9P219 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC88CQ9P219 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC88CQ9P219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms