Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC167Q9P0B6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC167Q9P0B6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms