Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPF1Q9NWY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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