Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX18Q9NVP1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms