Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCF3Q9NUQ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF3Q9NUQ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF3Q9NUQ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms