Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMSN1Q9NSI8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAMSN1Q9NSI8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMSN1Q9NSI8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms