Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC40A1Q9NP59 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC40A1Q9NP59 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms