Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN2Q9H4D0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLSTN2Q9H4D0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms