Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1A7

POLR2J3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3Q9H1A7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2J3Q9H1A7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2J3Q9H1A7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2J3Q9H1A7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms