Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP8

KRTAP17-1, Keratin-associated protein 17-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP17-1Q9BYP8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP17-1Q9BYP8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP17-1Q9BYP8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP17-1Q9BYP8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms