Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL4Q9BYD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL4Q9BYD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL4Q9BYD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms