Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSEN34Q9BSV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSEN34Q9BSV6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms