Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF4Q9BSR8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF4Q9BSR8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms