Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PYM1Q9BRP8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PYM1Q9BRP8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PYM1Q9BRP8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms