Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SH2D3AQ9BRG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH2D3AQ9BRG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.4 ms