Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GORASP1Q9BQQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GORASP1Q9BQQ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GORASP1Q9BQQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms