Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USB1Q9BQ65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms